在肛门周围形成孔洞
肛瘘是直肠与肛门周围的皮肤形成了一条通道造成。由于肛门周围的脓液积存，在肛门周围形成慢性脓肿导致肛瘘。也就是说大肠与皮肤在肛门周边形成了一条通道，这种疾病被称为肛瘘。由于肛瘘是与大肠相通，通常是不能自愈的。而且，肛瘘与平时的痔疮不同，如果长时间不进行治疗，会出现恶化，发展为肛瘘癌。由于在大肠癌中预后非常不理想，也正因为是臀部的疾病，所以一定不要犹豫，如果疑似肛瘘，建议请尽快到医院就诊。
由于细菌进入肛门腺所导致
造成肛瘘的主要原因是由于腹泻等疾病导致细菌进入到肛门内的组织中。在齿状线上方有被称为肛隐窝的凹陷处，和排出粘液的肛门腺组织。由于肛隐窝的凹陷处非常小，通常大便不会进入，但腹泻时，大便就会容易进入到肛隐窝，肛门腺也会受到大肠杆菌等细菌的侵入。
当大肠杆菌进入到肛门腺时，由于周边或有伤口、或因精神压力、或身体免疫力下降等原因，会引起化脓感染，造成肛门周边脓肿。就如同像细菌进入到牙齿的缝隙中，形成蛀牙一样。而且，当肛门周边脓肿继续发展的话，会与肛门内外形成通道，导致肛瘘。形成肛瘘后，一旦长时间不进行治疗，可能还会发展为多条通道的复杂性肛瘘，到这时在治疗上就比较困难了。
肛门周围化脓，偶尔会伴有高烧
首先，肛门周围化脓会伴有肿胀和跳痛感，造成无法下坐，时而会伴有38度以上的发热，这就是肛门周边脓肿。在这个阶段会流出脓水，如在医院进行切开排脓治疗，症状会有暂时改善。但由于囊肿与肛门腺相连，虽然疼痛感较少，但会经常有脓水流出，将内衣物污染。这种状况就是慢性肛瘘。
检查与诊断方法？
多数情况医生会询问发生经过和进行肛门诊察。如有疼痛感虽然较少，但有脓水由肛门周围流出，污染内衣物的症状发生，即可做出诊断。由于治疗时需要对通道的位置进行确认，还需进行肛门超生或MRI检查。
另外，有极少数患者会患有溃疡性大肠炎或克隆病等，由于炎症性肠病是全身疾病的症状之一，也会有发生肛瘘的情况，对疑似此类病情的话，还需要进行肠镜检查。
手术治疗时，特别需要注意的是保留肛门功能
肛瘘只有进行手术才能治愈。对于手术最重要的是消除通道入口，和保留肛门功能。就是说手术后，不能影响正常的排便功能。
肛瘘手术有将负责肛门肌肉收缩作用的括约肌和肛瘘通道一同切除的【开方法】和不需切除括约肌，只切除通道的【挖出法】。如果切除大部分括约肌，会造成肛门松弛，无法控制排便。由于肛瘘的通道离肛门较近，可以进行小范围的括约肌切除术，这就是开方法。其他还有通常所使用的挖出法，肛瘘挂线法是利用丝线或橡胶圈穿过肛瘘通道，进行绑定，之后渐渐放开手术方法。虽然这种方法比较花费时间，但是对括约肌的伤害很小。